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谷歌將開放云平臺(tái):欲破解自閉癥遺傳密碼

2014-12-11 09:50:27   作者:   來源:CTI論壇   評論:0  點(diǎn)擊:


  過去15年來,針對網(wǎng)絡(luò)上雜亂無章的信息,谷歌一直在完善其識(shí)別技術(shù)。現(xiàn)在,該公司將利用這些專業(yè)知識(shí),尋找包含在人類基因組數(shù)據(jù)海洋中有關(guān)導(dǎo)致自閉癥的遺傳線索。

  美國自閉癥研究公益組織“自閉癥之聲”(Autism Speaks)周二宣布,該組織正與谷歌合作,對1萬名自閉癥患者及其家庭成員的基因組進(jìn)行排序。谷歌將存儲(chǔ)和管理這些數(shù)據(jù),并對合格的研究人員開放這些數(shù)據(jù)。在他們尋找可能為自閉癥遺傳根源的變異DNA時(shí),可對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行篩選。

  “自閉癥之聲”首席科學(xué)官羅布·林(Rob Ring)表示:“我們認(rèn)為,理解自閉癥的線索存在于基因組中。我們希望利用與互聯(lián)網(wǎng)搜索類似的技術(shù)和方法,對人類的基因組進(jìn)行搜索,從而尋找這些失蹤的答案。”

  該項(xiàng)目將利用一個(gè)名為“谷歌基因組”(Google Genomics)的工具,谷歌幾個(gè)月前在其云計(jì)算平臺(tái)上不聲不響地推出了該工具。

  人類基因組測序的速度變得越來越快,而價(jià)格越來越便宜,羅布·林稱,現(xiàn)在完成一次人類基因組測序只要花費(fèi)2500美元,相比之下,當(dāng)年的人類基因組計(jì)劃(Human Genome Project)花費(fèi)了近30億美元。這使得研究人員產(chǎn)生的基因數(shù)據(jù)呈天文數(shù)字般地增長。通過允許研究人員將數(shù)據(jù)存儲(chǔ)到其服務(wù)器上,谷歌得以顯示和改進(jìn)其云計(jì)算的功能,同時(shí)為基因組研究提供了一個(gè)潛在的重要服務(wù)。

  “谷歌基因組”工程主管、前Google+項(xiàng)目工程主管大衛(wèi)·格雷澤(David Glazer)指出,人類基因組的搜索不是搜索關(guān)鍵字,研究人員可以搜索基因組的特定片段及基因組序列,從而找到具有共同變異的基因組片段。因?yàn)橐粋(gè)人的基因組可以多達(dá)100千兆字節(jié),讓這些數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在一個(gè)中央服務(wù)器中,便于研究人員更容易地開展遠(yuǎn)程協(xié)作。

  “自閉癥之聲”總裁利茲·費(fèi)爾德(Liz Feld)表示,她強(qiáng)烈希望遺傳分析將有助于研究人員推出更加個(gè)性化的治療方法,因?yàn)榛蚪M分析讓人們對癌癥的不同亞型有更精確的認(rèn)識(shí)。費(fèi)爾德說:“對我們來說最重要的事情是,這項(xiàng)研究將會(huì)讓我們能夠發(fā)現(xiàn)和理解各種形式的自閉癥。”

  自閉癥基因組計(jì)劃可能是谷歌首次進(jìn)軍醫(yī)療和藥品領(lǐng)域。該公司已瞄準(zhǔn)從帕金森癥到癌癥所有人類目前尚未攻克的病癥,而它擁有的技術(shù)實(shí)力讓它有能力開展基因組學(xué)研究。近年來,研究人員已經(jīng)看到,生物學(xué)有助于人們加深對計(jì)算方式的理解。畢竟,大自然已經(jīng)花費(fèi)了數(shù)十億年的時(shí)間完善DNA,讓其作為存儲(chǔ)和傳輸信息的最有效方式。

  羅布·林表示,“自閉癥之聲”自己收集基因組數(shù)據(jù)已超過了10年的時(shí)間。他說,現(xiàn)在,他相信谷歌等公司有能力在這方面做一些有價(jià)值的事:“我們意識(shí)到,我們一些最大的生物學(xué)問題是真正的大數(shù)據(jù)問題。”

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